Di famiglia bolognese, Ercole Panzacchi si laureò in entrambi i diritti il 21 marzo 1592 e fu in seguito ascritto al Collegio canonico. Dal 1591 al 1595 fu lettore di istituzioni legali, poi passò alla cattedra di diritto canonico, che occupò fino all'anno accademico 1626-1627.
S. MAZZETTI, Repertorio di tutti i professori antichi e moderni della famosa Università e del celebre Istituto delle scienze di Bologna, Bologna, 1848, p. 234